Lyra leeft in Oxford in een parallelle wereld. Als Lyra's beste vriend spoorloos verdwijnt, gaat ze met behulp van een magisch gouden kompas op zoek naar hem. Ze komt in contact met heksen, eigenzinnige wetenschappers en de pratende ijsbeer Iorek. Samen met hem gaat Lyra de strijd aan met de meest gevaarlijke wezens om het kwaad te verslaan.